जुलाई 2018 में आईएससी के गठन के साथ, (1) अफ्रीका, (2) एशिया और प्रशांत और (3) लैटिन अमेरिका और कैरिबियन में अंतर्राष्ट्रीय वैज्ञानिक संघ परिषद (आईएससीयू) के तीन पूर्व क्षेत्रीय कार्यालय स्वचालित रूप से आईएससी के क्षेत्रीय कार्यालय बन गए, और आईएससीयू सदस्यों के स्व-संगठित यूरोपीय समूह ने आईएससी के सभी यूरोपीय सदस्यों को शामिल करने के लिए अपनी सदस्यता का विस्तार किया।
अल साल्वाडोर सरकार के एकतरफा फैसले के बाद, लैटिन अमेरिका और कैरिबियन के लिए क्षेत्रीय कार्यालय दिसंबर 2019 में बंद हो गया। इसी तरह, अफ्रीका में क्षेत्रीय कार्यालय के लिए दक्षिण अफ्रीकी विज्ञान और नवाचार विभाग और दक्षिण अफ्रीका के विज्ञान अकादमी द्वारा और एशिया-प्रशांत क्षेत्र में क्षेत्रीय कार्यालय के लिए मलेशिया के विज्ञान अकादमी द्वारा प्रदान की गई मेजबानी व्यवस्था 2021 में समाप्त हो गई।
अपने संचालन के पहले तीन वर्षों (2019-2021) के दौरान, ISC गवर्निंग बोर्ड ने ISC के महत्वाकांक्षी नए विज़न और मिशन को क्रियान्वित करने के उद्देश्य से ठोस योजनाओं के विकास की दिशा में काम किया, जिसमें एक मजबूत क्षेत्रीय उपस्थिति हासिल करने के लिए संबंधित कार्य शामिल थे, जो पूर्व क्षेत्रीय कार्यालयों के मूल्यवान अनुभवों और समर्थन नेटवर्क पर आधारित थे। लैटिन अमेरिका और कैरिबियन क्षेत्र के लिए क्षेत्रीय फोकल प्वाइंट 2018 में अपने गठन के बाद अंतर्राष्ट्रीय विज्ञान परिषद (ISC) की पहली नई क्षेत्रीय उपस्थिति थी, जिसका 75,000 साल की अवधि के लिए 3 यूरो का स्वीकृत वार्षिक बजट था।
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